Ihren Ursprung nahm die Fonstone GmbH 2006 durch die Gründung von einigen ehemaligen Microsoft Mitarbeitern, welche dort in der Beratung von internationalen Grosskunden tätig waren. Die erfolgreiche und grösser gewordene Fonstone GmbH, wurde im Jahr 2011 in eine Aktiengesellschaft umgewandelt.

Der Fokus der Beratung lag ursprünglich im Bereich Messaging und Directory Services mit den Produkten und Lösungen Microsoft Exchange, Active Directory und Meta Directory. Die Fonstone AG war aber vor allem auch über die Schweizer Grenze hinaus Pionier bei Microsoft Unified Communications Projekten, die ihren Anfang mit den Produkten Live Communications Server (LCS 2005) und Exchange 2007 Unified Communication hatten.

Es war bald klar, dass es einen starken Partner bei der Integration der Telefonie brauchte, so dass schon im ersten Jahr nach der Gründung eine enge Kooperation mit AudioCodes, einem Anbieter von Kommunikationslösungen, entstand. Innerhalb dieser Partnerschaft wurde nun daran gearbeitet, Microsoft Exchange 2007 Unfied Messaging und bald auch Microsoft Office Communications Server 2007 und die Folgesysteme mit Telefonsystemen verschiedener Hersteller und PSTN Providern zu integrieren.

Im Laufe der Jahre hat sich die Fonstone AG zusammen mit ihren Partnern basierend auf allen neuen Produkten und Lösungen im Messaging und Unified Communications Bereich bis hin zu den aktuellen Cloud Anbindungen weiter entwickelt und bietet ihren Kunden heute die optimalen Lösungen an.